Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slit3Q9WVB4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit3Q9WVB4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit3Q9WVB4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms