Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUE3

Cyb561d2, Cytochrome b561 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d2Q9WUE3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyb561d2Q9WUE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyb561d2Q9WUE3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms