Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stub1Q9WUD1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stub1Q9WUD1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms