Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkraQ9WTX2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkraQ9WTX2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkraQ9WTX2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms