Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb3Q9R1P1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb3Q9R1P1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms