Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mpdu1Q9R0Q9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms