Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpxQ9R0M3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpxQ9R0M3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpxQ9R0M3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms