Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BcamQ9R069 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcamQ9R069 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcamQ9R069 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms