Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tomm40Q9QYA2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tomm40Q9QYA2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms