Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapbQ9QY76 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms