Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms