Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apbb1Q9QXJ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apbb1Q9QXJ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb1Q9QXJ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms