Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChmQ9QXG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChmQ9QXG2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms