Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limd1Q9QXD8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms