Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim44Q9QXA7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms