Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-OaQ9QWV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-OaQ9QWV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-OaQ9QWV1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms