Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga2bQ9QUM0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itga2bQ9QUM0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms