Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolkQ9QUG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolkQ9QUG2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolkQ9QUG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolkQ9QUG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolkQ9QUG2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolkQ9QUG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolkQ9QUG2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolkQ9QUG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms