Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaja4Q9JMC3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnaja4Q9JMC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms