Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms