Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upk3aQ9JKX8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upk3aQ9JKX8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms