Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trem1Q9JKE2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms