Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trem3Q9JKE1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem3Q9JKE1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem3Q9JKE1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms