Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alyref2Q9JJW6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms