Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfra4Q9JJT2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra4Q9JJT2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms