Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PigbQ9JJQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PigbQ9JJQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms