Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpf2Q9JJ80 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpf2Q9JJ80 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf2Q9JJ80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms