Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2ird1Q9JI57 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms