Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Exosc9Q9JHI7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Exosc9Q9JHI7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Exosc9Q9JHI7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Exosc9Q9JHI7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms