Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rb1cc1Q9ESK9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rb1cc1Q9ESK9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms