Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clstn2Q9ER65 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clstn2Q9ER65 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms