Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt112Q9DCG9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt112Q9DCG9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt112Q9DCG9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms