Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp27a1Q9DBG1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms