Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkar1aQ9DBC7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms