Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc89Q9DA73 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms