Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efhc1Q9D9T8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efhc1Q9D9T8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms