Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e2Q9D902 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e2Q9D902 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e2Q9D902 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms