Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx5Q9D8U8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms