Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc91Q9D8L5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc91Q9D8L5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc91Q9D8L5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc91Q9D8L5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms