Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8L0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms