Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc52a2Q9D8F3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc52a2Q9D8F3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Slc52a2Q9D8F3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms