Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chp2Q9D869 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chp2Q9D869 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms