Protein–RNA interactions for Protein: Q9D807

2200002J24Rik, RIKEN cDNA 2200002J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002J24RikQ9D807 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2200002J24RikQ9D807 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2200002J24RikQ9D807 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms