Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capns2Q9D7J7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capns2Q9D7J7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capns2Q9D7J7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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