Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D7E4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms