Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf13Q9D777 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf13Q9D777 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms