Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr42e1Q9D665 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms