Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spsb1Q9D5L7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spsb1Q9D5L7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms