Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930447A16RikQ9D5F6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.7 ms