Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930449I24RikQ9D5E3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930449I24RikQ9D5E3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms